Au moins 20 personnes ont été tuées lors de ces attaques et le ministère confirme samedi que deux Suisses sont au nombre des victimes.
Ces deux personnes se trouvaient dans le restaurant cible de l'attaque.
Aucune indication n'a été donnée par les autorités suisses sur l'identité des victimes.
Cependant, la presse suisse indique de sources concordantes samedi qu'il s'agit de personnalités du canton du Valais, soit Jean-Noël Rey, un ancien directeur de la Poste Suisse et ancien député fédéral, et de Georgie Lamon, un ancien député cantonal.
Le chef de la diplomatie suisse, Didier Burkhalter s'est déclaré profondément attristé par cet acte de brutalité.
Nous condamnons cet acte terroriste avec la plus grande fermeté, nous remercions les autorités des pays qui sont intervenus pour mettre fin à ces actes de violences et nous demandons que tout soit entrepris pour retrouver et juger les auteurs de ces attentats. Nos pensées sont en ce moment avec les familles et les proches des victimes, a déclaré M. Burkhalter.
Selon un dernier bilan provisoire publié samedi soir, 29 personnes ont été tuées et une trentaine d'autres blessées dans l'attaque d'un commando jihadiste contre un hôtel et un restaurant de Ouagadougou fréquentés par les étrangers.
Le précédent bilan des autorités burkinabè faisait état de 26 morts.